А что Вы думаете о Сатурне?

Все планеты образовались из каменистых планетезималей, в том числе и газовые гиганты. Газовые гиганты образовались из крупных планетезималей, которые притянули из протопланетного облака очень много газа и пыли. Внутри газовых гигантов находится ядро, образовавшееся  из каменистой планетезимали, которое претерпело изменения под действием огромного давления и температуры. Скорее всего произошло расслоение вещества в ядре, а вследствие радиоактивного распада может быть образовалось много железа. Ядро Юпитера в 2-3 раза тяжелее Земли. Под толстым слоем атмосферы Юпитера, под большим давлением и температуре водород переходит в металлическое состояние. Твердый металлический водород образуется под меньшим давлением, чем жидкий. Поэтому под атмосферой Юпитера находится твердый металлический водород, а ниже, возможно, есть слой металлического водорода в жидком состоянии. Металлический водород является сверхпроводником, и токи, текущие внутри образуют сильное магнитное поле планеты.

Да, это ничему не противоречит. Газовые гиганты и Солнце содержат много водорода.
Кроме водорода в исходном протопланетном облаке была пыль из тяжелых элементов, воды и примесей других газов. Из пыли образовались планетезимали, так же образовались и кометы. Планетезимали притягивали и удерживали пыль, и росли, пока не набрали достаточно много массы. Маленькая планета, как луна, не может удержать никакую атмосферу. Планета побольше не может удержать атмосферу из лёгкого водорода и гелия.  Планеты земного типа не содержат водорода в атмосфере, их атмосферы состоят из газов с тяжелыми молекулами: азот, кислород, углекислый газ, метан и др., а водород и гелий не удерживаются гравитацией, и уходят из атмосферы в космос.  Водород на этих планетах находится только в  химических соединениях в виде воды, углекислого газа, метана, углеводородов и т.п. Планеты, планетезимали с большой массой могут удержать атмосферу из водорода и гелия. Так случилось, что почти весь водород протопланетного облака в Солнечной системе собрался притяжением Солнца и тяжелых газовых гигантов.

Так и есть. Юпитер в 2.47 раз тяжелее всех остальных планет солнечной системы, а Солнце в 1000 раз тяжелее Юпитера.

Нет противоречия. Кометы не могут удерживать газообразный водород. Но они содержат химические соединения, богатые водородом: водяной лёд, соединения с серой, углеродом, азотом и т.п. Остатки водорода, вероятно, находятся в облаке Оорта в виде газа.
Что же, по-вашему является источником энергии звезды? Именно термоядерные реакции - источник энергии звёзд, а водородный цикл - только начало. В недрах звёзд образуются все тяжелые химические элементы, но разные термоядерные реакции запускаются не сразу,  а в процессе эволюции звезд. Звёзды не обязательно состоят из водорода, известны, например, кислородные звёзды. Химические элементы всех комет, планет и живых существ, когда-то образовались в недрах звёзд. Вещество, из которого мы состоим, - остаток от взрыва сверхновой произошедшего в далеком прошлом, до образования солнечной системы.