Взаимодействие происходит через обмен фотонами.  Может ли фотон, обладающий нулевой массой, придать частице скорость, больше своей собственной?

Никто не измерял скорости глюонов и кварков внутри частиц.

Данные, полученные с помощью инструментов не только не точны, но и общая картина объектов и явлений зависит от самих инструментов. Например. Изображение объекта, полученное с помощью эхолокации отличается от фотографии. Картина, полученная с помощью оптического микроскопа отличается от электронного. "Зондирование"  одних частиц другими частицами высоких энергий приводит на следующий уровень. Получение знаний нового уровня не отрицает знания о предыдущем, но дополняет и углубляет их, приближаясь к абсолютной истинности на еще один шаг.

Пока я вижу только несовершенство. "Инструментом" ускорения в коллайдере являются электромагнитные поля. Но невозможно электромагнитными полями преодолеть барьер скорости света.
Так же, как невозможно преодолеть его никакими двигателями на химическом топливе.
Канву нашего четырехмерного пространства-времени создают электромагнитные поля. Эта канва искажена чем-то внешним, создавая эффект гравитации. Значит в природе есть силы, распространяющиеся быстрее электромагнитных, т.е. быстрее скорости света.

Не имеет. Наука имеет инструменты для установления относительной истинности, но постоянно совершенствует их.

А я высказалась про мозг. Достигнуто понимание не абсолютности истины, и мозг будет работать в поисках  абсолютности истины. Мир не ограничен, и поиск не ограничен, не смотря на ограниченность пяти органов чувств, доступных объемах памяти и скорости мышления. Возможности разума и человечества не ограничены.