В копилку морских и придонных бактерий можно добавить статью Александра Маркова
(Алекса́ндр Влади́мирович Ма́рков (род. 24 октября 1965) — российский биолог, палеонтолог, популяризатор науки. Лауреат главной в России премии в области научно-популярной литературы «Просветитель» (2011 год)[2]. Лауреат премии «За верность науке» Министерства образования и науки РФ в категории «Популяризатор года» (2015 год)[1] Окончил биологический факультет МГУ в 1987 году. В Палеонтологическом институте РАН с 1987 года. Доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник Палеонтологического института РАН. В 2014 году принял руководство кафедрой биологической эволюции биологического факультета МГУ. Профессор РАН (2016).)


Статья старая 2008 года на сайте Элементы
http://elementy.ru/novosti_nauki/430738

[I]Прокариоты — бактерии и археи (= архебактерии) — составляют, возможно, половину всей биомассы на планете. Согласно одной из оценок, общая масса углерода, заключенного в клетках прокариот, достигает 550 млрд тонн (Whitman et al., 1998) — примерно столько же, сколько во всех растениях и животных, вместе взятых. Но даже эта колоссальная цифра может оказаться заниженной, поскольку мы еще очень мало знаем о «подземной биосфере» — разнообразных и многочисленных микробах, обитающих в толще горных пород глубоко под землей и в особенности под океанским дном.

Предполагается, что в полостях и трещинах осадочных и вулканических пород под дном океанов может скрываться до 2/3 всех микробов, обитающих на планете (из оставшейся трети подавляющее большинство обитает под поверхностью суши, в толще континентальной коры — вплоть до глубин 5–7 км). Однако для уточнения этих оценок нужны прямые данные, то есть непосредственные количественные оценки численности и разнообразия микроорганизмов в пробах, полученных в ходе глубоководного бурения. Получение таких данных — дело весьма трудоемкое и дорогостоящее. До сих пор рекордная глубина, на которой были обнаружены живые микроорганизмы, составляла 842 метра под уровнем морского дна. Микробы были найдены в морских отложениях возрастом до 3,5 млн лет при температуре до 55°C....


....Количество микробов в пробах колебалось вокруг среднего значения [B]1,5 млн клеток на куб. см. — это типичная плотность микроорганизмов для глубоких слоев морских осадков[/B].

[/I]

Дополнение по бактериям занимающим нишу под почвами до глубины 3 км

В оценке по горным породам по которым мы насчитали 60 млрд тонн для планеты фраза выглядит так

[I]Содержание сапрофитных бактерий в горных породах невелико, около 2-3 тыс. клеток в 1 г субстрата. В нефтеносных породах даже на глубине 500 и 700 м насчитывается 30-100 млн. клеток в 1 г породы. [/I]

Там еще есть и по воде цифры
[I]Содержание микроорганизмов в воде пресных водоемов ниже, чем в почвах и илах, но достаточно высоко (1,4 млн. клеток в 1 см3 воды и более).[/I]

Но сапрофиты -те, кто питается мертвой и разлагающейся органикой. Сухие листья отмершие корни и тп.. В нефтеносных горизонтах конечно в трещинах органики много. Но таких областей мало . И че им, сапрофитам, действительно, делать на глубине 500-700 м. Что они забыли в минералах, в осадочных породах, в граните и базальте, составляющих верхние слои коры планеты? Да, корни деревьев глубоко уходят в землю за границы определяемые как почва примерно на глубину своей кроны -это десятки метров, но не сотни

Эти глубокие слои до 3 км должны занимать хемосинтетики, которые как я часто встречаю в разных источниках представляют [B]большинство бактерий Земли.[/B]

[I]Биологическое выветривание -- это процесс механического разрушения и химического изменения горных пород и минералов под действием растительных и животных организмов и продуктов их жизнедеятельности. Многочисленные микроорганизмы и корни растений в процессе своей жизнедеятельности выделяют во внешнюю среду углекислый газ и различные кислоты, которые оказывают разрушающее действие на минералы и горные породы. Так, силикатные бактерии, выделяющие CO2 и органические кислоты, разрушают полевые шпаты и фосфориты, освобождая при этом калий в доступной для растений форме и фосфорную кислоту. Некоторые железобактерии окисляют и разрушают соединения железа. Масляно-кислые и нитрифицирующие микроорганизмы разлагают апатиты и силикаты. Значительную роль в биологическом выветривании играют диатомовые водоросли, которые способствуют выветриванию каолинита и растворению известняков. Установлено значительное воздействие сине-зеленых водорослей и нитрифицирующих бактерий на гранит. При разложении остатков растений и микроорганизмов образуются гуминовые кислоты, которые ускоряют разрушение минералов и горных пород.[/I]


[B]Серобактерии [/B]окисляют сероводород H2S до молекулярной серы S или до солей серной кислоты H2SO4:
2H2S + O2 → 2H2O + 2S + 272 кДж
Выделяющаяся в результате свободная сера накапливается в бактериальных клетках в виде множества крупинок. При недостатке сероводорода бесцветные серобактерии производят дальнейшее окисление находящейся в них свободной серы до серной кислоты:
2S + 3O2 + 2H2O → 2H2SO4 + 636 кДж

[B]Железобактерии [/B]окисляют двухвалентное железо Fe до трёхвалентного и использовать освобождающуюся при этом энергию на усвоение углерода из углекислого газа или карбонатов:
4FeCO3 + O2 + 6H2O → 4Fe(OH)3 + 4CO2↑ + 324 кДж
Аналогично окисляется марганец.
[B]Нитрифицирующие[/B] бактерии окисляют аммиак NH3, образующийся в процессе гниения органических веществ, до азотистой HNO2 и азотной кислоты HNO3, которые, взаимодействуя с почвенными минералами, образуют нитриты и нитраты.
Первый этап осуществляют бактерии Nitrosomonas:
2NH3 + 3O2 → 2HNO2 + 2H2O + 662 кДж
Второй этап окисления образовавшейся азотистой кислоты осуществляется бактериями Nitrobacter:
2HNO2 + O2 ⇔ 2HNO3 + 101 кДж
Тионовые бактерии способны окислять тиосульфаты, сульфиты, сульфиды и молекулярную серу до серной кислот. Некоторые из них, как например Thiobacillus ferrooxidans, окисляют сульфидные минералы, а также закисное железо. Конечным продуктом окисления тионовыми бактериями молекулярной серы и различных ее соединений является сульфат.
При окислении серы и тиосульфата Т. denitrificans в анаэробных условиях за счет использования нитратов реакция выглядит так:
5S + 6KNO3 + 4NaHCO3 → 2Na2SO4 + 3K2SO4 + 2CO2↑ + 3N2
5Na2SO4 + 8KNO3 + 2NaHCO2 → 2Na2SO4 + 4K2SO4 + 4N2 + CO2↑ + H2O
ΔF = -75,2×104 дж.
[B]Водородные[/B] бактерии способны окислять молекулярный водород:
2H2 + O2 → 2H2O + 235 кДж
При этом происходит создание органического вещества (условно: CH2O):
6H2 + 2O2 + CO2 → (CH2O) + 5H2O
Карбоксидобактерии близки к водородным бактериям. Карбоксидобактерии окисляют монооксид углерода CO по реакции:
25CO + 12O2 + H2O + 24CO2↑ + (CH2O).
[B]Метанообразующие [/B]бактерии, анаэробны, и условиях осуществят следующую реакцию, в которой углекислый газ служит не только единственным источником углерода, но и конечным акцептором электронов при окислении водорода с образованием метана CH4:
4Н2 + CO2 → CH4↑ + 2H2O
Подробнее: http://cyclowiki.org/wiki/%D0%A5%D0%B5%D0%BC%D0%BE%D1%81%D0%B8%D0%BD%D1%82%D0­%B5%D0%B7

И вот их основное население почвообразующих и горных пород я найти не могу пока нигде в цифрах.

Meshulam,
Я прошу прощения - меня не было на форуме три дня я не видела вашего текста. Мы тут нашу избушку на курих ножках утепляли на зиму  - она большая, 250 м и я начала считать, что мы как-то много ресурсов газа на двоих лопаем, считая себя защитниками экологии. Подумывали даже полдома на зиму блокировать. В общем повысили герметичность, и экологичность.

Я не возражаю против бактерий-фотосинтетиков  - в смысле я не могу возражать обосновано - точных сведений по ним отдельно у меня действительно нет.
Примерные мои мотивации предыдущего текста
[B]Заболоченные почвы [/B](нашла пока нечто не очень ясное по источнику и подтверждений в достоверных работах нет)
Общая площадь в мире, занятая болотными почвами, по данным Л. Хейкурайнена составляет 150 млн га, Н. Я. Каца — 175 млн. га, В. Бэрка и П. О’Хара — 220 млн. га

Кто эти добрые люди понятия не имею  - пока не искала.

Всего почв в мире по учебнику ГЕОГРАФИЯ ПОЧВ С ОСНОВАМИ ПОЧВОВЕДЕНИЯ 2009 год.
108824,5 тыс. кв. км (без площади Антарктиды) то есть 10882450000 га то есть 10 882,45 млн га

И насколько я помню по учебе в универе их действительно немного -несколько процентов.
Я согласна что употребление терминов  в узком и измененном смысле мешает пониманию происходящего. Это же вообще лоскутное одеяло, если выкинуть 10% под предлогом того, что можно этим пренебречь, то выкинув что-нибудь пять раз получаем половину мира.
Я поэтому так долго окончательных цифр не вывожу - пытаюсь собрать больше информации. Если всем пренебрегать, это за час можно сделать или как мой муж за 5 минут всех бактерий в мире посчитал - пост № 11 этой темы.
Если считать просто 10 882,45 млн га это 10 млрд га, если бактерий 1-5 тонн на гектар
это в [B]почвах от 10 до 50 млрд тонн[/B], в слое до 3 км в глубину еще примерно столько же по расчетам поста 11 в этой теме:
[I] Например, если у поверхности 1 млн. клеток в 1 г. породы (2*10^12 шт/куб. м) и убыль их в 1000 раз происходит за 1000 м глубины, то общее число клеток в породах равно 2,8*10^14 * 5*10^14 = 1,4*10^28, а по массе это около 6*10^12 кг (6 млрд. тонн).
Если убыль не в 1000, а в 100 раз, то, соответственно, 60 млрд. тонн, и наоборот.[/I]

То есть по самым максимальным расчетам без учета местности [B]бактерий 110 млрд тонн[/B]
а растений по школьному учебнику 2400 млрд тон.
То есть бактерии просто смешны как претенденты на доминирующую по массе жизнь.

Но лесной покров оценивается учебниками ВУЗов как средний в 30 тон на гектар. Может сверху почвы. Корень каждого дерева примерно равен кроне. Ладно умножаем на 2. Лесов 30% почвы, трава наверное 10 % по массе к лесам, то есть максимум, те же 100 млрд тонн на поверхности почв 10 млрд га. Откуда 2400 млрд тонн сухого вещества растений на поверхности Земли? Это на гектаре должно быть не максимальных 30 тон на га , [B]а 240 тонн на каждом гектаре[/B ] почвы, включая арктические, субарктические и пустынные и полупустынные. Средняя елка 15 метров высотой весит примерно 300 кг с кроной с корнем 600 кг, гектар это квадрат 100 на 100 м. И на таком квадрате при массе 240 тонн получается 400 елок. В гектаре 10 000 кв м то есть одна елка занимает 20-30 кв метров. Для густого леса это вроде нормально выглядит, с учетом того, что деревья достигают часто 30, а некоторые 50 метров, есть подлесок, то есть они распределены по высоте в трехмерном пространстве. А для арктики и пустыни четто это слишком. Там вообще никого почти нет и бактерий в песке и в арктике конечно мало. А поля и луга... Леса 30% почв, то есть плотность в лесах должна быть примерно втрое выше.

Фентези вроде эти 2400 млрд тон зеленых растений. Но и 100 млрд тонн получается следующая картина   - тогда в лесу елок меньше в 24 раза. Одна елка на 480 кв метров в среднем, в лесах которые 30%  - 480/100*30=144 кв м на одно среднее дерево. Тоже фентези. При картине 2400 млрд тон в лесу 1 дерево помещается в 6 кв метрах. Так как распределение неравномерное должны быть участки еще гуще.

Цифру лесов сегодня пересчитаю по массе древесины из доклада Министерства природы. Все что было выше это подсчеты без учета реального распределения. Так можно считать если мы хотим узнать как устроена вселенная за 2 часа. Такой подход тоже есть. Я не особенный его фанат. Мой принцип  - узнать как устроена вселенная за одну человеческую жизнь. Картина конечно тоже получается примерная, но немного лучше.
:)

Я сегодня хочу вечером или завтра,  выложить все цифры того, что получилось в уже найденных источниках - просто перевести все что есть в одну систему координат. Есть граммы на куб метр в океанах, есть граммы в куб  см в диссертации по почвам.
В общем сравнить разные источники в одной системе координат.

И профили по распределению в глубину.

Еще про цианобактерии и океан. Я не перешагнула через этот вопрос. Просто по океанам и водной среде вообще у меня пока самые неопределенные цифры. Я ими собираюсь заняться, спасибо, что напоминаете об этой части биосферы. Она самая сложная для изучения, наверное поэтому цифры в разных источниках так широко отличаются.