В США работодатель приобретает имущественные права на ПО на основании зарплаты, потому что у них нет закона о личных авторских правах на ПО.
Если я правильно понимаю, у нас формально права приобретаются на основании соглашения между Советом Общества по управлению интеллектуальной собственностью и авторами, в котором указывается сумма вознаграждения, и которое заключается на основании "Свидетельства " и акта о внедрении.
Но фактически работодатель приобретает имущественные права сразу же с начала разработки, без оформления бумаг, и аргументирует свои права именно предоставлением места работы и зарплаты.
Та тысяча рублей работодалетем рассматривается всего лишь как способ пощрения тех работников, которых ему хочется поощрить, и не обидеть себя любимого. Через начальника могут проходить десятки таких свидетельств. К фактическому авторству относятся пренебрежительно. Так, мне было велено удалить из прилагаемого к реферату исходного текста программы все фамилии авторов, поскольку кроме моей фамилии там других фамилий не было.

Можно иметь зарплату существенно выше, не занимаясь сложным и объемным программированием, просто "надо уметь общаться с людьми". Так многие и поступают. Кроме меня,  - наивное "буратино"  со сравнительно небольшой зарплатой, которому трудно усидеть без дела.

Обычно инициатором оформления авторских прав является начальник, он же указывает кого надо включить, иногда под угрозой наказания. Ну и начальников тоже. Однажды я возмутилась, он обиделся,  и сказал, чтобы я его больше не включала. Я не включала.