В науке не говорят о природных программах когда нет четкого описания алгоритма и соответственно экспериментального получение естествознания. Но в рамках философии науки вполне допустимо введение каких-то новых понятий.

Природа, или "природный компьютер" несоизмеримо сложнее компьютера который подчиняется детерминистическим законам классической физики. "Природный компьютер" - полноценный квантовый компьютер, который предстоит еще только создать, создать квантовую систему, которая работает с программами являющимися лишь частично алгоритмическими. В молекуле ДНК заложена программа которая определяет специфику и особенности в развитии способностей и организма в целом. Процесс старения запрограммирован генетически. Природой заложена программа самоисцеления и выживания. Всё это программы в которых нет четко зафиксированного набора чисел. Как пример "программа выживания": в программе выживания нет четкого алгоритма, т.к. эволюционные преобразования связаны с окружающей средой, жестко закреплено лишь то, что при слишком больших отклонениях существо не выживет. Каждый организм - результат взаимодействия между генетической программой его развития и условиями ее реализации - наследуются задатки способностей, а для развития способностей необходима "благодатная почва", т.е. благоприятные условия социальной среды.

Когда говорят о природных программах - у бывших советских, кто получил образование в СССР, возникает ассоциации с Богом, идеализмом и т.п. Все это следствие укоренившемся в сознании представлении о месте диалектического материализме в науке. В Советском Союзе диалектический материализм был поставлен на службу идеологии и политики, был единственной основой науки, культуры и социальной жизни в целом, в соответствии с этим ряд естественных и общественных наук были объявлены буржуазными лженауками, как следствие технологическое отставание от развитых стран Запада и отставание по уровню научных исследований.

Материализм (ровно как идеализм) - философское мировоззрение. Провозглашение, как единственно верной, философской системы взглядов на природу и общество без каких бы то ни было доказательств - противоречит положениям науки. Как показал исторический опыт, реализация идей диалектического материализма оказался неудачным, что вполне закономерно, - не может быть в науке никаких базовых постулатов.

Что же касается такого понятия как "программа природы", всё новое это хорошо забытое старое, - дарвинизм, номогенез, ортогенез, онтогенез - по сути представляют собой концепции о внутренней запрограммированности развития природы и организмов. :)