Тяжёлому ковиду нашли ещё один ген
Вероятность тяжёлой коронавирусной инфекции зависит от активности гена, влияющего на противовирусную защиту лёгочных клеток.
Тяжесть коронавирусной инфекции COVID-19 зависит от многих факторов: от возраста (пожилые переносят её обычно хуже, чем молодые), от пола (мужчины переносят ковид хуже женщин), от сопутствующих болезней, от генов. Летом мы писали, что в нашем геноме есть тринадцать участков, которые явно влияют на вероятность заразиться SARS-CoV-2 и на то, насколько тяжёлой окажется болезнь. Здесь корректно говорить именно об участках генома, а не о генах, потому что в некоторых случаях получилось установить только зону в той или иной хромосоме, которая влияет на ковид, а вот что именно там находится, ещё предстоит выяснить. Тем не менее, в летней статье в Nature говорилось также и о некоторых генах, которые сумели определить в этих участках.
В новой статье в Nature Genetics сотрудники Оксфордского университета описывают ещё один ген, который имеет отношение к тяжёлому ковиду. Исследователи изучали участок на третьей хромосоме, про который уже было известно, что он вдвое повышает вероятность умереть от COVID-19 у людей моложе 65 лет. То есть этот участок, конечно, есть у всех людей, но последовательность генетических букв там может несколько отличаться. И вот у некоторых людей участок на третьей хромосоме оказывается в таком варианте, при котором течение COVID-19 очень тяжёлое.
Исследователи проанализировали огромное количество генетических данных из разных типов клеток и пришли к выводу, что ковидные особенности участка третьей хромосомы имеют значение для клеток лёгочного эпителия. Удалось определить, что именно делает этот участок — он оказался энхансером. Так называют последовательности, которые не кодируют никаких белков, но влияют на активность генов. Без энхансера ген хотя и может работать, но вполсилы. Притом энхансерная последовательность необязательно находится рядом со своим геном — энхансер может отстоять от него на тысячи нуклеотидов; более того, у одного энхансера может быть несколько «подопечных» генов, а у одного гена — несколько энхансеров.
В данном случае речь идёт о связке энхансера с геном LZTFL1. В зависимости от того, какой вариант энхансерной последовательности достался человеку, ковидом он будет болеть сильнее или слабее. Энхансер тяжёлого ковида встречается у 60% коренных жителей Южной Азии, а также их потомков в других частях света. Среди людей европейского происхождения опасная последовательность есть у 15%, у людей афро-карибского происхождения — только 2%.
Сам ген LZTFL1 мало изучен, его функции в точности неизвестны. Мы знаем только, что от него зависит, как клетки лёгких реагируют на вирус, но при этом он не входит в число иммунных генов, которые управляют воспалением, синтезом антител, активностью иммунных клеток и т. д. То есть реакция на вакцину от LZTFL1 и его энхансера не зависит. Возможно, изучив LZTFL1 получше, мы сможем создать лекарство, которое не давало бы коронавирусу обосноваться в лёгких.
