... ну у вас и представления о экспериментах с элементарными частицами. Вы всерьез полагаете, что можно вот так вот взять три "частицы", подобрать для них траектории и столкнуть в строго определенном месте одновременно?
Экспериментаторы имеют дело со "следами" элементарных частиц после столкновения. Вы только сопоставьте скорости и размеры частиц и сразу будет понятно, что и в "миллион-первый" раз вряд ли получится. А еще принцип неопределенности...

Во-первых, само собой разумеется, что  речь идёт о максимальной скорости, т.е., об амплитуде скорости, если уж мы говорим о колебаниях.
И если максимальная скорость мала, то и промежуточные значения малы тем более.
Во-вторых, размер амплитуды перемещения здесь имеет первостепенное значение, потому что амплитуда скорости пропорциональна амплитуде перемещения при постоянной частоте.
Пусть частица колеблется  с амплитудой А по оси X около начала координат.
Тогда её мгновенная координата в момент t :
x(t) = A*Sin(omega*t)
Чтобы найти мгновенную скорость, продифференцируем это выражение:
v(t) = dx(t)/dt = A*omega*Cos(omega*t)
Как видите, амплитуда скорости пропорциональна амплитуде перемещения. Если амплитуда перемещения стремится к нулю, то туда же стремится и скорость.



Вы что же, думаете, что Вам все эти вопросы растолкуют "на пальцах" на форуме?
Об этом написаны тома учебников и монографий. Читайте книги по физике твёрдого тела.

Если в общих чертах и "на пальцах", то колеблются атомы целиком, но при этом их электронные оболочки несколько деформируются. При этом связь между атомами в кристалле обеспечивают внешние электромагнитные поля электронных оболочек.
Если учесть, что масса ядра несоизмеримо больше, чем масса оболочки, то ясно, что ядро играет роль тяжёлой "гирьки", а электронные оболочки и их внешние поля - роль "невесомой пружины".
Ясно также, что атом в кристалле не является самостоятельной фигурой, поскольку он связан упругими связями со всей кристаллической решёткой. Стоит тронуть один атом, и по всему кристаллу побегут упругие волны, отражаясь и переотражаясь от всех границ кристалла. Именно эти волны и являются носителями тепловой энергии. А поскольку всё в микромире подчиняется квантовым законам, то и эти волны можно рассматривать, как  потоки квантовых квазичастиц -фононов. Фононы в кристалле в некотором смысле аналогичны атомам идеального газа с точки зрения термодинамики.

Ну, не хотите весь учебный материал - читайте Википедию

Увы, "объяснить" в Вашем понимании, т.е., свести к бытовым и макроскопическим представлениям электронные связи в молекулах  и кристаллах, имеющие квантовую природу, к сожалению, не получится.

Нет, это означает, что ни у кого нет желания доказывать что-либо упертому и малоинформированному человеку, который своей целью ставить не изучение фактов, а отрицание их самих.