Да, наверное, Вы правы в том, что выражение "лазерные импульсы (фотоны)" подразумевает, что в импульсе несколько фотонов. Хотя говорят, что нынче уже делают и источники единичных фотонов. Но это такое ... И, думается, что если такой источник очень сложный и дорогой, - значицца, только  потому  в данном случае пользовали источник, который генерирует очень  слабые лазерные импульсы, - такие, когда в одном  импульсе только несколько фотонов. Ну, и раз так, почему бы и не заснять им было в движении только один из этих фотонов? Что они и сделали. Рассеивая там всяко-разное по поверхности помидора ...
То, что в видеоролике, - это другое, - просто в виде развлекательного бонуса к сообщению решили показать движение, да, - светового луча.